1、检验检疫证书的法律效力主要体现在以下方面：
（1）是出入境货物通关重要凭证；
（2）是海关征收和减免关税的有效凭证；
（3）是履行交接、结算及进口国准入的有效证件；
（4）是议付货款的有效证件；
（5）是明确责任的有效证件；
（6）是办理验资的有效证明文件；
（7）是办理索赔、仲裁及诉讼的有效政证件。
2、检务部门签发证单出境应在2个工作日完成，入境应在5个工作日内完成。检验检疫机构签发的证单以验讫日期为签发日期。
3、《运输工具检疫处理证书》适用于对出入境运输工具的熏蒸和消毒。
4、格式4－1《动物卫生证书》和格式9－4动物检疫证书》适用于活动物的出入境。
5、出境货物通关单的有效期为：
（l）一般货物为60天；
（2）鲜活类货物14天；
（3） 植物和植物产品为21天，北方冬季可适当延长至35天。
6、在证单签发后，报检人要求更改或补充内容的，应填写《更改申请单》，经原发证检验检疫机构审核批准后，按规定予以办理。遗失证单的，必须在《国门时报》登报申明作废，提供经法人代表签字、加盖公章的书面说明，经原发证检验检疫机构审核批准后，方能重新补发证书。
7、品名、数量／重量、检验检疫结果、包装、发货人、收货人等重要项目更改后与合同、信用证不符的，或者更改后与输出、输人国家法律法规规定不符的，均不得更改。
8、对于已签发证单的出境货物，改换包装或重新拼装的必须重新报检。超过检验检疫有效期的出境货物应重新报检。对于出境的货物已申请复检一次不合格，经返工整理后不可再申请复检，应重新报检。
9、索赔证书一般使用中英文签发，根据需要也可以使用中文签发。