十七大报告首次把“建设生态文明”明确列为我们党的奋斗目标，同时也是全面建设小康社会的新要求。党一直强调建设社会主义物质文明和精神文明，十六大在此基础上提出了建设社会主义政治文明，十七大报告首次提出建设生态文明。这表明，环境资源问题已经成为党中央的关切重点。加强生态建设，实现社会经济可持续发展，是关系中华民族生存与发展的根本大计。 建设生态文明，是对人类工业文明向生态文明转型规律的历史性把握，是对人与自然和谐发展的深刻洞察，是贯彻落实科学发展观的必然要求，也是我们党科学发展、和谐发展理念的一次重大发展。当前，我国经济持续高速增长，为人们提供了丰富的物质文化生活产品，但环境污染、生态破坏、资源短缺等问题也日渐严重，这对环境审计提出了新的目标和更高的要求。
近年来审计署先后安排了对排污费、天然林保护和退耕还林等专项资金，以及对“三河一湖”水污染防治情况的审计和审计调查。这对促进我国环保政策的落实、提高环保资金的使用效率、维护财经法纪、督促地方政府加大环境保护力度和资金投入等方面发挥了积极的作用，并初步探索了环境审计的路子。
但是，我国环境审计目前还处于探索阶段，一是在审计实践上开展的时间不长，虽然经过几年的实践，逐渐摸索出一些规律，但与其他专项审计相比还很不成熟，与国外环境审计相比差距更加明显。二是在审计理论上首先表现在目前国内对环境审计的定义还没有统一的定论，对环境审计的概念认识也不统一。三是缺乏环境审计标准、环境审计准则和健全完整的环境审计评价体系，在开展环境审计时不规范、不统一，实践中只能摸着石头过河，工作开展比较困难，审计风险也较大，环境审计还难以深入有效的进行。四是审计人员知识结构、审计手段、审计方法等还不能很好地适应工作的需要。另外，在人们思想上，尚未充分认识到环境审计的意义及发展前景，从而阻碍了环境审计的推广与深化。
环境审计工作必须与党的建设生态文明目标相适应。一是针对我国实际科学界定环境审计概念，加强与环保部门和专家的合作，共同研究环境审计理论和技术方法。二是研究探索、逐步建立环境审计准则，促进和完善我国环保法律体系及政策，提供可靠的环境审计依据和评价标准，健全环境审计评价体系，努力使环境审计的范围、内容、方法等走向制度化和实务操作的规范化。三是加强审计人员的培训和对外交流。四是在环境审计实践中努力探索绩效审计，有效遏制各种以破坏资源环境换取经济增长的行为。